Obsah

• Obsah: Rozdíl mezi Genomic Library a cDNA Library
• Srovnávací tabulka
• Co je Genomic Library?
• Co je knihovna cDNA?
• Klíčové rozdíly

Genomická knihovna i knihovna cDNA se používají při klonování genů k izolaci různých DNA. Rozdíl mezi oběma těmito knihovnami spočívá v tom, že genomická knihovna obsahuje fragmenty DNA, které exprimují celý genom organismu, zatímco v knihovně cDNA je mRNA odebrána z konkrétních buněk organismu, a pak cDNA sestává z této mRNA v reakci, která je katalyzována enzymem.

Obsah: Rozdíl mezi Genomic Library a cDNA Library

• Srovnávací tabulka
• Co je Genomic Library?
• Co je knihovna cDNA?
• Klíčové rozdíly

Srovnávací tabulka

Základ	Genomická knihovna	cDNA knihovna
Definice	Genomická knihovna je kolekce kompletní genomické DNA z jednoho organismu. DNA je uložena v populaci podobných vektorů, z nichž každý obsahuje odlišný inzert DNA.	Knihovna cDNA je směs klonovaných fragmentů cDNA vložených do výběru hostitelských buněk, které společně tvoří část transkriptomu organismu.
Výraz	Celý genom	Pouze specifické geny.
Velikost	Větší	Menší
Introny	Aktuální	Absent
Vektor	Využívá plasmidy, kosmidy, lambda fágy, YAC a BAC pro uložení velkých fragmentů.	Nejsou to žádné introny, takže využívá plazmidy, fagemidy a lambda fágy k přizpůsobení skromných fragmentů.

Co je Genomic Library?

Při postupu klonování genu je požadovaný gen zkopírován z DNA oddělené od organismu. Když je DNA oddělena od organismu, byly její geny extrahovány najednou. DNA organismu obsahuje tisíce různých genů. Genetický inženýr najde jeden specifický gen, který kóduje konkrétní sledovaný protein.

Neexistuje absolutně žádná metoda, pomocí které by byl určitý gen z DNA k dispozici, takže vědci vytvářejí knihovny genů pro katalogizaci DNA organismu. Vědci, pak vyberte požadovaný gen v knihovně. Genová knihovna je skupina živých bakteriálních kolonií, které byly transformovány jedinečnými kousky DNA v organismu, který je původem požadovaného genu. DNA je extrahována z organismu, aby se vytvořila knihovna, která je organizovanou formou DNA. Genomická knihovna a cDNA jsou dva druhy genových knihoven. Jako genové strategie v rekombinantní technologii bylo použito mnoho technik klonování genu.

Fragmenty DNA se oddělí štěpením specifickými restrikčními enzymy z rodičovské DNA. Tyto fragmenty jsou ligovány do vektorových molekul a nahromaděné molekuly jsou přesunuty do hostitelských buněk, 1 molekula v každé buňce. Genomická knihovna se skládá z intronů, nezdravé DNA a řady dalších fragmentů. V této knihovně je DNA rozdělena na menší fragmenty uvnitř buňky. Poté jsou všechny malé části vloženy do vektoru, aby se vytvořila knihovna. Genomická knihovna obsahuje veškerou DNA celých genů a buňka se skládá ze všech jejich intronů. Genomická DNA je překlad celého genomu. Nekóduje celou část na jednom kodonu kvůli velikosti intronů. V genomické knihovně neexistuje žádný sestřihový mechanismus, který by způsoboval potíže s expresí genů odebraných z této knihovny.

Co je knihovna cDNA?

Knihovna cDNA je konstruována výběrem jednoho typu tkáně nebo buňky. Následně se z této tkáně nebo buňky izoluje mRNA. DNA kopie molekuly mRNA sestává ze specifického enzymu reverzní transkriptázy. Knihovna cDNA tedy obsahuje specifickou DNA, která je přítomna v mRNA. V této knihovně nejsou nalezeny žádné introny ani sekvence DNA. V této knihovně jsou všechny klony plné délky. Klon cDNA je dále nezbytný pro transfekci buněk pro produkci proteinu nebo pro testy založené na buňkách.

Klíčové rozdíly

1. Genomická knihovna byla napsána přímo z genomické DNA.
2. cDNA knihovna byla vytvořena použitím mRNA jako templátu.
3. Genomická knihovna zabírá celý genom tohoto organismu.
4. cDNA knihovna představuje pouze geny konkrétních onemocnění.
5. Pro konstrukci genomické knihovny jsou důležité dva enzymy, restrikční endonukleázy a ligázy.
6. Enzym reverzní transkriptázy hraje významnou roli při konstrukci knihovny cDNA.
7. Genomická knihovna zabírá DNA jak prokaryotických, tak eukaryotických organismů.
8. cDNA knihovna představuje DNA právě eukaryotických organismů.
9. cDNA knihovna je schopna genomové exprese u bakterií prokaryotických, protože postrádají introny.
10. Genomická knihovna není schopna říci v prokaryotickém organismu, protože má introny a prokaryotický organismus nemá žádné stroje pro zpracování intronů.